这两地可以乘坐地铁一号线。
根本百度地图显示，从南京南站到鼓楼医院两地相距13.8公里，可以乘坐地铁前往，从南京南站乘坐地铁1号线（八卦洲大桥南方向）到鼓楼站（1口出）下车，最后步行220米，即可到达目的地南京鼓楼医院，全程耗时33分钟。