麻衣神算子昆仑被灭的原因是曾经卜算出了一个预言。预言了蒙古大军会入侵中原，而这个预言被误传给了蒙古军。蒙古军得知后，认为昆仑是中原人的奸细，于是派人前往昆仑府将其灭门。麻衣神算子昆仑是金庸先生的武侠小说《神雕侠侣》中的角色，是一位武功高强的大侠，擅长算命和卜卦。