飞哥与小佛：超时空之谜的剧情简介
故事叙述一个巧妙的契机，在泰瑞进入飞哥小佛家五周年纪念日当天，飞哥做了一个用大型鸭嘴兽羽毛球机器，而且两人就坐在里头，在阴错阳差之下撞上了背着两人驾着火箭车出任务的泰瑞，意外弹到了杜芬舒斯家中，飞哥与小佛因此结识了杜芬舒斯，并帮杜芬舒斯修好被他们撞烂的超时空终结者，刚好泰瑞在此时闯进杜芬舒斯家，因为不能被家中主人发现，所以只好变回毫无威胁性的鸭嘴兽。飞哥帮忙修好机器后，一行人进入了另一个时空。那个时空是一个被穿黑袍的独眼杜芬舒斯独裁统治的三州地区，莫来管队长则成了独眼杜芬舒斯底下的助理。[1]
独眼杜芬舒斯把自己那个时空的鸭嘴兽泰瑞给改造成了自己的邪恶部属，而此时泰瑞也在情急之下暴露了自己的身份，秘密特务的身份让飞哥很不谅解，他把泰瑞当成家人，而家人是不该有秘密的，独眼杜芬舒斯命令机械鸭嘴兽去攻击鸭嘴兽泰瑞，在经过一番缠斗之后暂时甩掉了他，但鸭嘴兽泰瑞却想独自去对付独眼杜芬舒斯却失败被俘，飞哥想回到自己的时空，但是时空终结者的遥控器却失灵了，于是他们去找属于那个时空的自己，却发现另一个自己却和本身判若两人，毫无想像力，而且不知道暑假是什么。 于是他们又去找了那个时空的伊莎贝拉，发现伊莎贝拉是杜芬反抗军的一名军官，而飞哥的朋友们在那个时空也都成了反抗军的一员，凯蒂斯则是反抗军头领。另一方面独眼杜芬舒斯听了杜芬舒斯所叙述的另一个三州地区，于是想利用时空终结者到飞哥本来的时空进行大规模侵略，但是杜芬舒斯却忘了怎么启动，独眼杜芬舒斯只好利用手上的鸭嘴兽泰瑞当人质把飞哥他们全抓过来，杜芬舒斯在此时想起了如何改造，开启了时空之门，但独眼杜芬舒斯却因为杜芬舒斯过于懦弱，所以把他连同飞哥他们一起送去喂怪兽，此时那个时空的凯蒂斯救了他们，并用时空之门展开大逃亡。他们逃回了自己的时空，却发现独眼杜芬舒斯的机器大军也入侵了自己的家园，于是他们找到藏在家里的密道，找到鸭嘴兽泰瑞留下来的秘密武器，原来是飞哥他们在暑假做的所有发明，两个时空的人用飞哥的发明合力击退了独眼杜芬舒斯的机械军团，飞哥摧毁了机器人的主控制台，让机器人全部当机，而鸭嘴兽泰瑞也打败了机械泰瑞，消除它的邪恶思想。杜芬舒斯用独眼杜芬舒斯最心爱的玩具火车头把他引回属于他的时空，并被反抗军和莫来管所擒。因为泰瑞暴露了自己的身份，所以必须遣往别处，凯尔建议用杜芬舒斯的记忆终结者消除他们的记忆，飞哥因为这一连串经历过于精彩所以舍不得删除，但小佛提醒他美好的记忆可以自己创造，但泰瑞只有一只，所以选择删除记忆，一切又回复正常。[1]（在删除记忆之前，伊莎贝拉亲了一下飞哥） 飞尼斯·福林(飞哥)(Phineas Flynn)美国:文森?马堤拉
就和平常一样，多话而且常有异想天开的发明。这次和小佛在阴错阳差下遇到汉兹杜芬舒斯，还帮他修好超时空终结者(The Other Dimension-ator)，也因此引爆一场灾难和冒险，和小佛背负着有史以来最艰巨的任务。
费柏·富雷查(小佛)(Ferb Flechter)美国:汤玛斯?桑格斯特
小佛就和平常一样不爱说话，但经常在节目最后说几句关键性的话。这次和飞哥一起修好杜芬舒斯的超时空终结者(The Other Dimension-ator)，并进入平行宇宙。最后面临要让身分曝光的派瑞被送走还是消除记忆，小佛提醒大家刺激好玩的冒险有很多，但是派瑞只有一个。因而让大家选择被消除记忆。
凯蒂丝·杰楚德·福林(Candace Jecherd Flynn)美国:艾絮莉?堤斯岱尔
凯蒂丝有时候会思考母亲琳达福林富雷查总是看不到飞哥与小佛发明的原因，这次她想像有种神秘力量的存在让大人永远看不到那些发明。当她听到杰洛米要上大学的消息，开始这种想像。当二度空间的杜芬舒斯机器人大军入侵时，凯蒂丝去找琳达并想像让这种“神秘力量”除去问题。就在凯蒂丝和琳达赶到现场后，刚好也是另一时空的杜芬舒斯全面撤退以后，因此也真的什么都看不到。虽然她在电视版﹝The Ballad of Badbeard、Wizard of odd﹞就已经知道派瑞就是特务，但记忆仍旧被删除。
史黛西·平野(Stacy Hirano)美国:胡凯莉
凯蒂丝的好友，也是一起讨论杰洛米的对象，有时候会被凯蒂丝拖去一起抓飞哥与小佛。这次凯蒂丝认为有一种神秘力量存在，让飞哥与小佛的发明会在大人接近的时候消失。史黛西听到凯蒂丝的说法，认为这只是凯蒂丝的异想天开。当凯蒂丝进入二度空间不见踪影，史黛西开始怀疑是自己说了不敬的话得罪凯蒂丝所说的神秘力量，摆一张桌子并堆上各种物品向“神秘力量”祈求凯蒂丝回来。驾驶黄色巨大树屋机器人对抗诺姆军团。
鸭嘴兽派瑞(台译泰瑞)(Perry the Platypus)美国:Bradly Baker
飞哥与小佛的宠物兼OWCA秘密特务，一开始到杜芬舒斯的邪恶企业就跟飞哥小佛一起进入另一时空。因为那里的杜芬舒斯看出它是秘密特务便叫“机械兽派瑞”(Perry the Platyborg)对其展开攻击，一开始派瑞遭到机械兽派瑞攻击时，并没有曝露特务身分，但另一时空的杜芬舒斯要求机械兽派瑞攻击飞哥与小佛时，为了保护飞哥与小佛而反击，也因此曝露身分(实际上在电视版已经在多人面前现身多次)。死敌为“机械兽派瑞”。电影中被邪恶杜芬舒斯威胁要其到他的邪恶企业却被欺骗当成谈判筹码(小游戏 Agent P Strikes Back 为派瑞到邪恶杜芬舒斯企业期间的插曲)。
汉兹·杜芬舒斯(台译汉斯)(Hienz Doofenshmirtz)美国:波文麦尔
在一开始他的超时空终结者被飞哥的大型羽球撞坏，飞哥帮他修理完便将它开启；一伙人到达另一时空。他和那里的邪恶杜芬舒斯意外成了好朋友(结果是被利用)，经过测试，他真的没能力认出一般鸭嘴兽和鸭嘴兽派瑞。最后他送邪恶杜芬舒斯他放置的小火车啾啾使其撤退。
伊莎贝拉·格拉希·夏普罗(Isabella Gracia Shapiro)美国:艾莉森?史托纳
住在飞哥家的对面。喜欢飞哥，在电影中帮助反抗军驾驶独角兽儿童车、棒球射击枪对抗诺姆军团，也在确定没有人会记得这一天发生过的事之后，吻了飞哥。(但众人的记忆随后遭到消除)
巴捷·雷?帕特勒(Baljeet Rai Patel)美国:马利克?潘丘里
印度移民，在电影的个性较没有二度空间的巴捷聪明、直率。和尔平驾驶钢嘴人一起对抗诺姆军团。
布佛·凡·斯东(Buford Van Stomm)美国:波比?盖勒
常欺负巴捷、飞哥；四肢发达、头脑简单。驾驶 鸭嘴兽母爱机 对抗诺姆军团。
尔平(Irving)
飞哥小佛终极粉丝。驾驶钢嘴人的下半身。星座算命说他很难被注意。
营边女孩(美眉家族)(Fireside Girls)
电影中帮助反抗军驾驶飞哥小佛的发明对抗诺姆军团。
就爱韩德尔(Love Handle)
飞哥与小佛在父母的结婚纪念日重新集结的乐团。这次诺姆军团大举入侵三州地区，飞哥与小佛和同伴们使用过去发明的复制品反击时，他们唱歌表演为飞哥与小佛助阵。
琳达·福林·富雷查(Linda Flynn Flechter)美国:Caroline Rhea
电影中和丈夫劳伦斯˙富雷查去看3D电影:那该死的未婚夫(妻)(That Darn Fiance)。和劳伦斯的戏份并不多。在电影还没看完的时候，被凯蒂丝拉出电影院“看飞哥和小佛做的好事”。就和往常一样，什么都没看到。
劳伦斯·富雷查(Lawrece Flechter)美国:Richard O'Brien
电影中和妻子琳达˙福林˙富雷查去看3D电影:那该死的未婚夫(妻)(That Darn Fiance)。和琳达的戏份并不多。
史莱许(Slash)
于电影版片尾曲出现，喜欢看飞哥与小佛。和巴头四的飞哥、小佛、布佛 以及 两只派瑞、邪恶杜芬舒斯唱片尾曲。 凯蒂丝·杰楚德·福林队长 (Captain Candace Jecherd Flynn)美国:Ashley Tisdale
二度空间的凯蒂丝是在那里的杜芬舒斯暴政统治下持续反抗的反抗军领袖。除了仍然会对野生防风草过敏，她经历的事件让她显得和一度空间的凯蒂丝不同。相较之下大多数时候身手灵活，打架招式华丽时尚，一人可打30架以上诺姆机器人；反抗军的重要人物。敌人为邪恶杜芬舒斯。在小游戏 Agent P Strikes Back 的通缉单上悬赏一万美金。
飞尼斯·福林(Phineas Flynn)美国:Vincent Martella、费柏·富雷查(Ferb Flechter)美国:Thomas Sangster
因为派瑞几年前失踪(遭杜芬舒斯绑架成为机械兽)加上杜芬舒斯下令不准有暑假存在而悠闲在家玩杜芬大富翁(Doof-poly)，为凯蒂丝保护。两人身上都穿着杜芬工作服，战斗服则是拯救凯蒂丝时穿上。飞哥天性较乐观；小佛则比一度空间的更沉默寡言，自从一度空间飞哥小佛告诉他们暑假的事后，他们才开始有信心，并帮助反抗军对抗杜芬舒斯。在小游戏 Agent P Strikes Back 的通缉单上两人都是悬赏各一万美金。线上小游戏 Dimension of Doom 登场为拯救凯蒂丝破坏邪恶企业内部，可能是杰洛米相助。
伊莎贝拉·格拉希·夏普罗 (Isabella Gracia Shapiro)美国:Alyson Stoner
反抗军的小军官将领，率领火风暴女孩(FireStorm Girls)，个性比较稳重；她说的Watch'a doing跟一度空间的音较不同，声音很重。
布佛·凡·斯东(Buford Van Stomm)美国:Bobby Gaylor
反抗军成员，喜欢凯蒂丝。因为他认为自己太行了(真的很行)，他开始反反抗，但最后还是帮助反抗军对抗杜芬舒斯。
巴捷·雷?潘特勒(Baljeet Rai Patel)美国:Maulik Pancholy
反抗军军师、参谋、博士。非常聪明，跟一度空间巴捷相比较不懦弱，也比较稳重。
火风暴女孩/反抗军(Firestorm Girls/The Resist Army)
葛蕾金、雅蒂森、凯蒂、霍莉、米莉、金吉。伊莎贝拉的部下。非常听命伊莎贝拉、凯蒂丝的指挥。
杰洛米·强生(Jeremy Johnson)美国:Mitshel Musso
在北部三州地区率领三人突击部队反抗杜芬舒斯，甚至帮助飞哥小佛闯入邪恶杜芬舒斯企业大肆破坏拯救凯蒂丝。
机械兽派瑞(Perry The Platyborg)美国:Dee Bradly Baker
二度空间的鸭嘴兽派瑞曾经和这里的杜芬舒斯对抗，但是已经被改造为半机器并成为部下，拥有旋转刀、雷射炮这些武器；诺姆军团的首领。最后在和一度空间的派瑞战斗后，摆脱二度空间的杜芬舒斯控制，并跟二度空间的飞哥与小佛回到自己的世界。在小游戏 Agent P Strikes Back 为每一关的头目。它的样子是参考魔鬼终结者，它手上的武器雷射炮、旋转尖槌造型则是参考变形金刚G1时期的密卡登在获得黑暗能量晶体时的新武器。
诺姆机器人军团(Norm-bots Army)
电影中以诺姆机器人为主，在二度空间的量产型机器人，会漂浮，听从统治者杜芬舒斯的指示监视大家。如果有人不服从，会变身为战斗模式展开攻击。诺姆机器人分成三种(无头盔慢速型、钢盔快速型、钢盔残暴型)，电影中只出现前两者，钢盔残暴型只在小游戏〈Robot Riot〉中出现，都是第二时空杜芬舒斯的军队。后来对一度空间的入侵行动，诺姆军团就是攻击主力。
杜芬机器人军团 (Doof-bots Army)
在电影并未出现，出现在平台电玩版〈飞哥与小佛-超时空冒险〉中。和诺姆军团都是第二时空杜芬舒斯的部下，杂鱼包刮: 三脚机器人、杜芬扫荡兵、杜芬链炮兵。中型头目: 杜芬飞船，大型杜芬机械兽则是最终头目等级之敌人。
琳达·福林·富雷查(Linda Flynn Flechter)美国:Caroline Rhea
一般都躲在家里的地下室。
劳伦斯·富雷查(Lawrence Flechter)美国:Richard O'Brien
到工厂工作一星期后才回家。
鸭嘴兽羽毛球拍
在电影中它让飞哥小佛见到了杜芬舒斯并与其展开互动。
超时空终结者
在本片可说是故事的主要关键，造成飞哥等人进入第二时空并引发种种冒险。它其实是麦可贝参考自己的执导电影变形金刚3中的能量柱集中时制造的太空桥，能从某区进入另一地区的物品，贝将它引用在本片中。
特务手表
是凯尔给派瑞的装备，可以吸取任何金属物质也能和基地联络。在电影中有几次被派瑞拿来拯救大家。在游戏〈Agent P strikes back〉中这个装备可说是不可或缺的武器。
飞哥、小佛、派瑞纪念照
基地的钥匙，只有特殊情况时使用，只有跟派瑞相关的人才能使用。派瑞就是拿它给飞哥，让飞哥得以进入它的基地。
自动复制系统
在诺姆军团大举侵入时，飞哥按照派瑞的指示找到其基地，而基地电脑使用本物品将飞哥小佛的夏日所有发明统统聚集在基地内部。