林萧和陈萱萱最终在一起。在小说《怦然心动》中，主要讲述了男主角林萧和女主角陈萱萱的故事。林萧和陈萱萱是同班同学，他们之间逐渐发展出了深厚的友谊和感情。最后，在一系列的情感纠葛和成长经历后，林萧和陈萱萱最终在一起了，走到了一起的爱情关系。他们之间的故事充满了青春的懵懂、成长的烦恼和深刻的情感体验。