吉林大学中日联谊医院由位于长春市朝阳区新民大街的原址迁至由吉林省、长春市政府拨地、卫生部拨款建筑、日本政府无偿援助26亿日元医疗设备的长春经济技术开发区自由大路新址，为感谢日本人民的真情厚意，医院经卫生部批准重新命名为白求恩医大三院（中日联谊医院）。2000年白求恩医科大学与吉林大学合并后医院正式更名为吉林大学中日联谊医院。